• facebook
  • לינקעדין
  • יאָוטובע

1. יקערדיק וויסן (אויב איר ווילן צו זען די יקספּערמענאַל טייל, ביטע אַריבערפירן גלייַך צו די רגע טייל)

ווי אַ דעריוואַט אָפּרוף פון קאַנווענשאַנאַל PCR, פאַקטיש צייט PCR מאָניטאָרס דער הויפּט די ענדערונג פון די סומע פון ​​​​אַמפּלאַפאַקיישאַן פּראָדוקט אין יעדער ציקל פון די PCR אַמפּלאַפאַקיישאַן אָפּרוף אין פאַקטיש צייט דורך די ענדערונג פון די פלואָרעססענסע סיגנאַל, און קוואַנטיטאַטיווע אַנאַליזעס די סטאַרטינג מוסטער דורך די שייכות צווישן די CT ווערט און די נאָרמאַל ויסבייג.

די ספּעציפיש דאַטן פון RT-PCR זענעןבאַסעלינע, פלורעסאַנס שוועלאוןקט ווערט.

באַסעלינע: די פלורעסאַנס ווערט פון די 3-15 ציקל איז די באַסעלינע (באַסעלינע), וואָס איז געפֿירט דורך די טיילמאָליק טעות פון די מעזשערמאַנט.
שוועל (שוועל): רעפערס צו די פלואָרעססענסע דיטעקשאַן שיעור שטעלן אין אַ צונעמען שטעלע אין די עקספּאָונענשאַל וווּקס געגנט פון די אַמפּלאַפאַקיישאַן ויסבייג, בכלל 10 מאל די נאָרמאַל דיווייישאַן פון די באַסעלינע.
CT ווערט: דאָס איז די נומער פון פּקר סייקאַלז ווען די פלורעסאַנס ווערט אין יעדער אָפּרוף רער ריטשאַז די שוועל.
די Ct ווערט איז פאַרקערט פּראַפּאָרשאַנאַל צו די סומע פון ​​די ערשט מוסטער.

 עטלעכע דערפאַרונג וועגן siRNA אין 1

פּראָסט לייבלינג מעטהאָדס פֿאַר RT-PCR:

אופֿן מייַלע כיסאָרן פאַרנעם פון אַפּלאַקיישאַן
SYBR גריןⅠ ברייט אָנווענדלעך, שפּירעוודיק, ביליק און באַקוועם אָנפאַנגער רעקווירעמענץ זענען הויך, פּראָנע צו ניט-ספּעציפיש באַנדס עס איז פּאַסיק פֿאַר קוואַנטיטאַטיווע אַנאַליסיס פון פאַרשידן ציל גענעס, פאָרשונג אויף דזשין אויסדרוק און פאָרשונג אויף טראַנסגעניק רעקאָמבינאַנט אַנימאַלס און געוויקסן.
טאַקמאַן גוט ספּעציפֿישקייט און הויך ריפּיטאַביליטי די פּרייַז איז הויך און בלויז פּאַסיק פֿאַר ספּעציפיש צילן. פּאַטאַדזשאַן דיטעקשאַן, מעדיצין קעגנשטעל דזשין פאָרשונג, מעדיצין עפיקאַסי אַסעסמאַנט, דיאַגנאָסיס פון גענעטיק חולאתן.
מאָלעקולאַר ביקאַן הויך ספּעציפֿישקייט, פלורעסאַנס, נידעריק הינטערגרונט די פּרייַז איז הויך, עס איז בלויז פּאַסיק פֿאַר אַ ספּעציפיש ציל, די פּלאַן איז שווער און די פּרייַז איז הויך. ספּעציפיש דזשין אַנאַליסיס, SNP אַנאַליסיס

עטלעכע דערפאַרונג וועגן siRNA אין 2 עטלעכע דערפאַרונג וועגן siRNA אין 3

2. עקספּערימענטאַל סטעפּס

2.1 וועגן די יקספּערמענאַל גרופּינג- עס מוזן זיין קייפל וועלז אין דער גרופּע, און עס מוזן זיין בייאַלאַדזשיקאַל רעפּאַטישאַנז.

ליידיק קאָנטראָל געניצט צו דעטעקט צעל גראָוט סטאַטוס אין יקספּעראַמאַנץ
נעגאַטיוו קאָנטראָל סירנאַ (ניט-ספּעציפיש סירנאַ סיקוואַנס) באַווייַזן די ספּעציפישקייט פון רנאַי קאַמף.סירנאַ קען ינדוסירן ניט-ספּעציפיש דרוק ענטפער אין אַ קאַנסאַנטריישאַן פון 200 נם.
טראַנספעקשאַן רעאַגענט קאָנטראָל ויסשליסן די טאַקסיסאַטי פון די טראַנספעקשאַן רייידזשאַנט צו די סעלז אָדער די ווירקונג אויף די אויסדרוק פון די ציל דזשין
סירנאַ קעגן ציל דזשין קלאַפּ אַראָפּ די אויסדרוק פון די ציל דזשין
⑤ (אַפּשאַנאַל) positive סירנאַ געניצט צו טראָובלעשאָאָט יקספּערמענאַל סיסטעם און אַפּעריישאַנאַל פּראָבלעמס
⑥ (אַפּשאַנאַל) פלורעסאַנט קאָנטראָל סירנאַ די עפעקטיווקייַט פון צעל טראַנספעקשאַן קענען זיין באמערקט מיט אַ מיקראָסקאָפּ

2.2 פּרינסאַפּאַלז פון אָנפאַנגער פּלאַן

אַמפּלאַפייד פראַגמענט גרייס פּרעפעראַבלי ביי 100-150 בפּ
אָנפאַנגער לענג 18-25 בפּ
גק אינהאַלט 30% -70%, פּרעפעראַבלי 45% -55%
טם ווערט 58-60℃
סיקוואַנס ויסמיידן ט / C קעסיידערדיק;א / ג קעסיידערדיק
3 סוף סיקוואַנס ויסמיידן GC רייַך אָדער AT רייַך;דער וואָקזאַל באַזע איז פּרעפעראַבלי ג אָדער C;עס איז בעסטער צו ויסמיידן טי
קאָמפּלעמענטאַריטי ויסמיידן קאַמפּלאַמענטשי סיקוואַנסיז פון מער ווי 3 באַסעס אין די אָנפאַנגער אָדער צווישן צוויי אָנפאַנגער
ספּעציפֿישקייט ניצן בלאַסט זוכן צו באַשטעטיקן אָנפאַנגער ספּעסיפיקאַטי

①סירנאַ איז מינים-ספּעציפיש, און די סיקוואַנסיז פון פאַרשידענע מינים וועט זיין אַנדערש.

②סירנאַ איז פּאַקידזשד אין פרירן-דאַר פּודער, וואָס קענען זיין סטאָרד סטאַביל פֿאַר 2-4 וואָכן אין צימער טעמפּעראַטור.

2.3 מכשירים אָדער רייידזשאַנץ וואָס דאַרפֿן צו זיין צוגעגרייט אין שטייַגן

אָנפאַנגער (ינערלעך רעפֿערענץ) אַרייַנגערעכנט פאָרויס און פאַרקערט צוויי
פּרימערס (ציל דזשין) אַרייַנגערעכנט פאָרויס און פאַרקערט צוויי
ציל סי רנאַ (3 סטריפּס) אין אַלגעמיין, די פירמע וועט סינטאַסייז 3 סטריפּס, און דעמאָלט קלייַבן איינער פון די דריי דורך RT-PCR
טראַנספעקשאַן קיט ליפּאָ2000 עטק.
רנאַ גיך יקסטראַקשאַן קיט פֿאַר רנאַ יקסטראַקשאַן נאָך טראַנספעקשאַן
גיך פאַרקערט טראַנסקריפּציע קיט פֿאַר cDNA סינטעז
PCR Amplification Kit 2×סופּער סיבר גרין
qPCR Master Mix

2.4 וועגן די ישוז וואָס דאַרפֿן צו זיין אכטונג צו אין די ספּעציפיש יקספּערמענאַל סטעפּס:

①סירנאַ טראַנספעקשאַן פּראָצעס

1. פֿאַר פּלייטינג, איר קענען קלייַבן 24-געזונט טעלער, 12-געזונט טעלער אָדער 6-געזונט טעלער (די דורכשניטלעך רנאַ קאַנסאַנטריישאַן פארגעלייגט אין יעדער געזונט פון אַ 24-געזונט טעלער איז וועגן 100-300 נג / ול), און די אָפּטימאַל טראַנספעקשאַן געדיכטקייַט פון סעלז איז אַרויף צו 60% -80% אָדער אַזוי

2. די טראַנספעקשאַן סטעפּס און ספּעציפיש רעקווירעמענץ זענען שטרענג אין לויט מיט די ינסטראַקשאַנז.

3. נאָך טראַנספעקשאַן, סאַמפּאַלז קענען זיין געזאמלט ין 24-72 שעה פֿאַר מרנאַ דיטעקשאַן (RT-PCR) אָדער פּראָטעין דיטעקשאַן ין 48-96 שעה (WB)

② רנאַ יקסטראַקשאַן פּראָצעס

1. פאַרהיטן קאַנטאַמאַניישאַן דורך עקסאָגענאָוס ענזימעס.עס דער הויפּט כולל טראָגן מאַסקס און גלאַווז שטרענג;ניצן סטעראַלייזד פּייפּעט עצות און עפּ טובז;די וואַסער געניצט אין דער עקספּערימענט מוזן זיין RNase-Free.

2. עס איז רעקאַמענדיד צו טאָן צוויי מאָל ווי סאַגדזשעסטיד אין די שנעל יקסטראַקשאַן קיט, וואָס וועט טאַקע פֿאַרבעסערן די ריינקייַט און טראָגן.

3. די וויסט פליסיק מוזן נישט פאַרבינדן די רנאַ זייַל.

③ רנאַ קוואַנטיפיקאַטיאָן

נאָך די RNA איז יקסטראַקטיד, עס קענען זיין קוואַנטאַפייד גלייַך מיט Nanodrop, און די מינימום לייענען קענען זיין ווי נידעריק ווי 10ng / ul.

④ פאַרקערט טראַנסקריפּציע פּראָצעס

1. רעכט צו דער הויך סענסיטיוויטי פון RT-qPCR, אין מינדסטער 3 פּאַראַלעל וועלז זאָל זיין געמאכט פֿאַר יעדער מוסטער צו פאַרמייַדן די סאַבסאַקוואַנט קט צו זיין צו אַנדערש אָדער די סד צו זיין צו גרויס פֿאַר סטאַטיסטיש אַנאַליסיס.

2. דו זאלסט נישט פרירן און טאָ האר מישן ריפּיטידלי.

3. יעדער רער / לאָך מוזן זיין ריפּלייסט מיט אַ נייַ שפּיץ!דו זאלסט נישט קאַנטיניואַסלי נוצן די זעלבע פּיפּעטטע שפּיץ צו לייגן סאַמפּאַלז!

4. די פילם אַטאַטשט צו די 96-געזונט טעלער נאָך אַדינג די מוסטער דאַרף זיין סמודד מיט אַ טעלער.עס איז בעסטער צו סענטריפודזש איידער איר שטעלן עס אויף די מאַשין, אַזוי אַז די פליסיק אויף די רער וואַנט קענען לויפן אַראָפּ און באַזייַטיקן לופט באַבאַלז.

⑤ פּראָסט ויסבייג אַנאַליסיס

קיין צייט פון לאָגאַריטהמיק וווּקס עפשער הויך קאַנסאַנטריישאַן פון מוסטער
קיין CT ווערט פאַלש סטעפּס פֿאַר דיטעקטינג פלורעסאַנט סיגנאַלז;
דערנידעריקונג פון פּרימערז אָדער פּראָבעס - זייַן אָרנטלעכקייַט קענען זיין דיטעקטאַד דורך PAGE עלעקטראָפאָרעסיס;
ניט גענוגיק סומע פון ​​מוסטער;
דערנידעריקונג פון טעמפּלאַטעס - אַוווידינג די הקדמה פון ימפּיוראַטיז און ריפּיטיד ייַז קאַלט און טאָינג אין מוסטער צוגרייטונג;
Ct>38 נידעריק אַמפּלאַפאַקיישאַן עפעקטיווקייַט;פּקר פּראָדוקט איז צו לאַנג;פאַרשידן אָפּרוף קאַמפּאָונאַנץ זענען דיגריידיד
לינעאַר אַמפּלאַפאַקיישאַן ויסבייג פּראָבעס קענען זיין טייל דיגריידיד דורך ריפּיטיד פרירן-טאָ סייקאַלז אָדער פּראַלאָנגד ויסשטעלן צו ליכט
דער חילוק אין דופּליקאַט האָלעס איז דער הויפּט גרויס דער אָפּרוף לייזונג איז נישט גאָר צעלאָזן אָדער די אָפּרוף לייזונג איז נישט געמישט;די טערמאַל וואַנע פון ​​די פּקר קיילע איז קאַנטאַמאַנייטאַד דורך פלורעסאַנט סאַבסטאַנסיז

2.5 וועגן דאַטן אַנאַליסיס

די דאַטן אַנאַליסיס פון qPCR קענען זיין צעטיילט אין קאָרעוו קוואַנטאַפאַקיישאַן און אַבסאָלוט קוואַנטאַפאַקיישאַן.פֿאַר בייַשפּיל, סעלז אין די באַהאַנדלונג גרופּע קאַמפּערד מיט סעלז אין די קאָנטראָל גרופּע,

ווי פילע מאל די מרנאַ פון די X דזשין ענדערונגען, דאָס איז קאָרעוו קוואַנטאַפאַקיישאַן;אין אַ זיכער נומער פון סעלז, די מרנאַ פון די X דזשין

ווי פילע עקזעמפלארן עס זענען, דאָס איז אַבסאָלוט קוואַנטיפיקאַטיאָן.יוזשאַוואַלי וואָס מיר נוצן רובֿ אין דער לאַבאָראַטאָריע איז די קאָרעוו קוואַנטיטאַטיווע אופֿן.געווענליך,די 2-ΔΔקט אופֿןאיז מערסט געניצט אין יקספּעראַמאַנץ, אַזוי בלויז דעם אופֿן וועט זיין באַקענענ אין דעטאַל דאָ.

2-ΔΔct אופֿן: דער רעזולטאַט איז דער חילוק אין דער אויסדרוק פון די ציל דזשין אין די יקספּערמענאַל גרופּע קאָרעוו צו די ציל דזשין אין די קאָנטראָל גרופּע.עס איז פארלאנגט אַז די אַמפּלאַפאַקיישאַן יפעקטיוונאַס פון ביידע די ציל דזשין און די ינערלעך רעפֿערענץ דזשין איז נאָענט צו 100%, און די קאָרעוו דיווייישאַן זאָל נישט יקסיד 5%.

די כעזשבן אופֿן איז ווי גייט:

Δct קאָנטראָל גרופּע = קט ווערט פון ציל דזשין אין קאָנטראָל גרופּע - קט ווערט פון ינערלעך רעפֿערענץ דזשין אין קאָנטראָל גרופּע

Δct יקספּערמענאַל גרופּע = קט ווערט פון די ציל דזשין אין די יקספּערמענאַל גרופּע - קט ווערט פון די ינערלעך רעפֿערענץ דזשין אין די יקספּערמענאַל גרופּע

ΔΔקט=Δקט יקספּערמענאַל גרופּע-Δקט קאָנטראָל גרופּע

צום סוף, רעכענען די קייפל פון חילוק אין אויסדרוק מדרגה:

טוישן פאָלד = 2-ΔΔct (קאָראַספּאַנדינג צו די עקססעל פונקציע איז POWER)

פֿאַרבונדענע פּראָדוקטן:

צעל דירעקט רט-קפּקר קיט
עטלעכע דערפאַרונג וועגן siRNA אין 4


פּאָסטן צייט: מאי 20-2023